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Scientific Data | 开运体育app官网下载侯有明教授团队解析棕榈科植物重大入侵害虫水椰八角铁甲基因组
发布时间 :开运体育app官网下载-06-04      浏览:12


水椰八角铁甲Octodonta nipae (Maulik) 属鞘翅目叶甲科,是棕榈科植物的重大入侵害虫,原产于马来西亚。由于缺乏高质量的基因组资源,使得我们难以理解其强入侵性和生态适应性。

开运体育app官网下载年5月30日,开运体育app官网下载侯有明教授团队在Nature旗下刊物Scientific Data发布了水椰八角铁甲染色体水平高质量基因组数据。该研究首先明确了水椰八角铁甲含9条染色体,其性别决定机制为XX+XO;进一步利用Illumina、PacBio和Hi-C技术,对水椰八角铁甲进行了基因组测序与组装,并将组装结果挂载到了9条染色体上。获得了1.3 Gb的染色体级别基因组,N50长度为1.022 Mb,结合RNA-seq数据对基因组进行注释,获得了16,305个蛋白编码基因。

1 水椰八角铁甲各龄虫态的形态特征

2 水椰八角铁甲染色体水平全基因组特征

3 水椰八角铁甲染色体与赤拟谷盗染色体的共线性分析

水椰八角铁甲高质量基因组的破译,不仅为认识该害虫入侵生物学特性和生态学现象提供了遗传基。参愿煤Τ孀酆现卫淼睦砺酆陀τ醚芯刻峁┝酥С。

开运体育app官网下载侯有明教授为论文通讯作者,开运体育app官网下载汤宝珍教授、中国计量大学生命科学开运体育app官网下载尹传林助理研究员、浙江大学农业与生物技术开运体育app官网下载贺康副研究员为论文并列第一作者。浙江大学昆虫所李飞教授、云南省农科院农业环境资源研究所刘莹副研究员也参与部分研究工作。本研究得到了国家重点研发计划(2022YFC2601405),国家自然科学基金面上项目(2022YFC2601405)和福建省自然科学基金(2020J01595)的项目资助。

论文链接:https://doi.org/10.1038/s41597-024-03417-7



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